百合益生菌抗生素滥用破坏肠道正常菌群，
健康的肠道菌群被认为有益于调节黏膜屏障功能，降低肠道通透性。有研究发现，肠道黏膜通透性异常与1型糖尿病（T1DM）的发生明显相关。健康的肠道菌群还能促进肠道免疫系统的成熟，清除有害病原菌。肠道菌群失调和菌群多样性的破坏也与T1DM的发生有关。在T1DM的儿童，肠道拟杆菌的比例明显增加，该菌的增加常导致机会性感染。
婴幼儿的肠道微生物定殖早在胎儿期就开始了，在出生后的1年内，不同菌属的比例会发生很大变化。分娩方式、喂养方法和早期的环境卫生，都可能影响菌群定殖的模式。新生儿的免疫系统需要快速的适应正常菌群和防御机会致病菌，肠道微生物能够影响炎症和正常免疫应答之间的平衡。 抗菌药物在婴幼儿人群中的使用相当普遍，有研究显示抗生素的使用破坏了肠道正常菌群，增加了儿童T1DM的发生风险。大约70%的胃肠炎是由病毒引起的，抗生素治疗通常无效，而益生菌则可以缩短腹泻持续时间，并可能使婴幼儿肠道免于扩大的炎症损害和免疫抑制的不利影响。
益生菌是一类对宿主有益的活性微生物，有助于维持宿主肠道正常菌群的稳态，调控肠道免疫。健康的婴幼儿可以安全使用益生菌，但是考虑到在幼儿开始加入固体食物时，饮食会成为影响肠道菌群成分的主要因素，益生菌可能仅在生命早期起到调节肠道菌群的作用。但作为早期的饮食因素，不清楚益生菌的使用，是否能够改变婴幼儿的肠道微生物定殖模式以及参与疾病的易感性。 目前多认为T1DM是在遗传因素的基础上，由外界因素引起的自身免疫反应，导致了胰岛细胞的免疫破坏。动物实验发现，益生菌能够调节肠道菌群，降低T1DM相关的自身免疫的发生风险。益生菌可以促进有益的免疫调节，预防T1DM的发生。最近发表在美国医学会儿科学（JAMAPediatrics）杂志上的研究发现，在T1DM遗传风险较高的儿童，生命早期（出生后0-27天）的益生菌补充降低了胰岛自身免疫的发生风险。 婴幼儿期容易发生感染性疾病，特别是生命早期的呼吸道感染常伴随胃肠道症状，如腹泻，这增加了益生菌使用的可能。早在刚出生的几周内，是益生菌调节肠道菌群的有效时间窗，有利于促进婴幼儿肠道免疫系统的成熟，抵抗环境中病原体的暴露。 在该研究中，生命早期使用益生菌减少胰岛自身免疫风险的作用，主要存在于携带高风险基因型DR3/4的儿童，而不是其他基因型，说明了遗传和环境的作用，该基因型可能影响了宿主免疫系统与益生菌之间的相互作用。 总之，对于发生T1DM风险较高的儿童，新生儿期的益生菌补充可能降低了胰岛自身免疫风险。
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